實驗室純水機可以有效的去除原水中的一些雜質，得到幾乎不含任何雜質的超純水。但是某一些客戶對超純水中的某些離子含量要求比較苛刻，要達到ppb級別。嶄新的超純水系統在前期運行的一段時間內是可以達到要求的，但是隨著耗材的不斷消耗，制出的超純水水質會略有下降，但是超純水中的某些離子含量可能會稍微上升，這時候用離子色譜儀可以真正的檢測出。但是因為超純水的探頭是測試綜合產水數據的儀表會暫時不檢出，只有當離子含量超過一定的聚集量才會有顯示水質下降。
實驗純水機室超純水是電阻率達到18.25兆歐，以及其中的任何離子、TOC、以及顆粒物等雜質都是趨向于0，可以說成是一種純度很高的水。由于它不含任何雜質，所以它們吸附雜質的能力也要比普通的水要強很多。細胞膜相當于半滲透膜，濃度差由外界溶液的濃度和細胞質的濃度來體現的。當外界濃度小于細胞質的濃度時候，細胞吸水膨脹。所以當一種濃度很低的超純水包圍細胞膜時，細胞會因過度吸水膨脹而破裂的可能。當然現實生活中如果人們飲用了超純水也不會使細胞膜膨脹而破裂的，因為人體內有很多的酶以及礦物質元素，所以超純水一旦進入人體就迅速被溶解氧化了。
流量計分為浮子流量計和電磁流量計，一個是利用浮子在流量計管道內的刻度來判斷流量的，一個是利用電磁感應來判斷流量的，準確度的話電磁流量計要更精確。純水系統中有很多點需要判斷流量的，進而可以了解它們的運行狀態，比如系統進水部分需要判斷原水的流量和壓力，可以方便及時調節進水開關，進水流量過快會導致反滲透膜的脫鹽率下降，進水流量過慢會導致純水產水量下降。還需要知道反滲透系統后的純水和廢水流量，這樣可以及時調節膜的脫鹽率，的保護反滲透系統。后級EDI以及終端也需要知道它們的流量。
純水系統調試前應該仔細檢查原水進水閥、沖洗排放閥、濃水排放閥、純水閥、RO高壓泵進出水口等是否開啟到位，注意剛剛開始調試的時候進水閥和濃水排放閥達到半開狀態后慢慢調節，純水和廢水的流量。一般單級反滲透純水和廢水比例應該在1:2，二級反滲透的話在2：3。注意此時一定要同時觀察膜的脫鹽率至少要在98%以上。同時以后系統運行中要注意保安過濾器的壓力表數值，一旦壓力升高0.5kg/cm2以上，就必須更換濾芯。這樣對系統具有很強的保護性。
超聲波在純水設備上面的用途：超聲波儀器是一類具有發生超聲波聲吶的儀器，它們有非常廣泛的應用。一些大的超純水設備在調試或者后期維護時候，由于不能停止運行等特殊原因，在定期維護時候，需要用超聲波探傷儀來檢查設備有否存在安全隱患，以有利于安全生產。還有超聲波清洗機可以對超純水設備的零部件進行有效的清洗、反滲透膜結垢也可以用超聲波清洗機來清洗處理，這樣可以大大的節約系統的運行成本。像超聲波加濕機可以把純水設備納入其中，這樣可以保證加濕的效果，防止顆粒物和粉塵進入加濕的空間。
超純水系統分為手動控制和全自動控制，由于一些客戶經費或者觀念上面的影響，客戶選配了手動控制的超純水系統。全自動控制的超純水系統是不需要去手動按鈕控制設備的運行的，控制和運行起來很方便。但是手動控制的超純水系統，也可以理解為半自動控制的系統，它們需要定期的手動維護設備。進水箱部分和純水箱部分通過浮標來控制設備的原水泵、反滲透增壓泵、純水泵的啟停，不過系統電路控制上面也會有控制它們啟停的額外按鈕，需要手動開啟它們，不過運行后就可通過浮標的上浮或者下沉來控制。
