1、外觀上：沒有嚴格的標準要求,所以外觀上沒有什么區別,他們外觀上的區別主要是填料塔的體積會比噴淋塔大一些.
2、功能：
填料塔：其核心點在于填料本身,如在廢氣治理過程中使用的填料塔,其工藝是在特定的填料中接種特定的菌種或微生物,使廢氣通過該填料層時,被菌種及微生物所吸收或降解,達到凈化的目的.因此,該填料塔的噴嘴數量不多,主要目的是維持該塔內的濕度、溫度符合微生物的代謝要求,塔徑的大小與治理廢氣的風量、工況（壓力損失）、投資方面有關.
其實驗模型就是：填料塔為無菌實驗室；填料為固體（半固體）生物培養基；噴嘴及其它為生物生長環境的調節.
噴淋塔：其核心點在于噴淋,即洗滌,同樣以廢氣治理過程中使用的噴淋塔,其工藝是根據所治理廢氣的相關指標（溫度、成分、PH、粉塵量等）設定噴淋液的種類、流量大小及噴淋頻率.為了達到較好的噴淋效果,其噴嘴數量一般比較多,塔徑大小與治理廢氣的風量、工況（壓力損失）、投資方面有關.
需要補充的是,有時為了加強噴淋洗滌的效果,會在噴淋塔中添加一些比表面積很大的填充物,如空心多面球、纖維束等物質,這與填料的本質區別在于：前者是為了增加廢氣與噴淋液的接觸面積,后者是給微生物生長提供基礎.

填料塔在廢氣治理工程、水處理工程中比較常見，噴淋塔則在廢氣治理工程、化工生產中比較常見.